交通运输管理学院下设交通运输系、物流系、国际航运管理系、经济贸易系、管理科学与工程系、邮轮游艇管理系、工商管理系、财务管理系等8个教学系；设有港口与航运、交通运输经济、国际航运人力资源、交通规划、世界经济、旅游科学、国际贸易和跨国投资、战略管理和系统规划、电子商务等研究所；设有物流系统工程、交通运输信息、营销策划、中小企业发展、创业管理、海洋开发与管理等研究中心，以及信息管理与系统研发中心。

目前学院有在校生4000余人，专任教师130余人，其中教授31人，副教授44人。博士生导师14人，硕士生导师50余人。

学院拥有交通运输规划与管理博士后流动站、管理科学与工程博士后流动站；管理科学与工程（一级学科）、交通运输规划与管理、物流工程与管理、交通工程等4个博士学位授权点；管理科学与工程、交通运输规划与管理、物流工程与管理、交通工程、产业经济学、技术经济学、国际贸易学、企业管理、工业工程等10个硕士学位授权点；交通运输工程、物流工程、项目管理等3个工程硕士学位授权点。管理科学与工程、交通运输规划与管理专业是省级重点学科。

学院拥有1个辽宁省物流航运管理系统工程重点实验室；1个交通运输管理实验教学中心，该中心下设信息管理与信息系统、电子商务、经济与商务、电子沙盘与创业模拟、运输管理、物流管理、物流设备与技术、港口工程与管理、金融与投资模拟等诸多实验室。

学院学术气氛活跃，在国际航运、外贸运输、物流工程与管理、港口设计与规划、港口经营与管理、工商管理、经济贸易、信息管理和电子商务等领域有较强的科研能力，承担了多项国家自然科学基金项目、国家社会科学基金和国家部委、省、市政府和大型企业的重大科研课题，多次获得国家和省部级奖励。